是的，分居三年可以离婚。根据《中华人民共和国民法典》的规定，夫妻因感情不和分居满两年，构成夫妻感情确已破裂的情形之一。如果双方无法通过协议离婚，其中一方可以向人民法院提起离婚诉讼。在诉讼过程中，如果法院认定双方感情确实已经破裂且调解无效，应当判决准予离婚。
需要注意的是，分居满三年并不自动解除婚姻关系，婚姻关系的解除需要通过离婚登记或者法院判决或调解的方式。此外，如果分居的原因不是因为感情不和，例如因工作原因，那么法律通常不会认定夫妻感情破裂而准予离婚
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